A fase de mata-mata do Campeonato Brasileiro Série D 2023 está definida. Os 32 clubes classificados para a segunda fase foram divididos em oito chaves de quatro equipes cada. Os vencedores de cada chave avançam para as quartas de final.

Aqui está o chaveamento da fase de mata-mata do Campeonato Brasileiro Série D 2023:

16 Avós	Oitavas	Quartas	Semifinal	Final
Maranhão 2 1 (5) Tuna Luso 3 0 (4)
	Maranhão 0 2 (6) Retrô 0 2 (5)
Pacajus 1 1   Retrô 2 2
		Maranhão       Ferroviário
ASA 1 1   Nacional de Patos 0 3
	Nacional de Patos 0 1   Ferroviário 0 3
Princesa do Solimões 1 0   Ferroviário 1 3
Inter de Limeira 0 1   Caxias 1 1
	Caxias 0 0 (7) Ceilândia 0 0 (6)
Vitória-ES 1 0   Ceilândia 0 3
		Caxias       Portuguesa RJ
Brasil de Pelotas 0 1   Patrocinesnse 0 2
	Patrocinesnse 0 1   Portuguesa RJ 0 3
Operário VG 1 0   Portuguesa RJ 0 4
Potiguar 1 0 (6) Bahia de Feira 0 1 (7)
	Bahia de Feira 2 2   Nacional-AM 0 3
Parnahyba 2 0   Nacional-AM 0 3
		Bahia de Feira       Athletic Club
Camboriú 0 1 (6) Maringá 0 1 (5)
	Camboriú 1 0   Athletic Club 0 2
Brasiliense 0 0   Athletic Club 2 0
Ferroviária 1 2 (4) Hercílio Luz 1 2 (3)
	Ferroviária 1 1   Anápolis 0 0
Democrata GV 0 1   Anápolis 0 3
		Ferroviária       Sousa
Águia de Maraba 1 0   Atlético-CE 1 3
	Atlético-CE 1 1   Sousa 2 2
Falcon 1 1   Sousa 1 2